معایب قفس مرغ تخمگذار نسبت به پرورش روی کف
سرمایه اولیه برای شروع بیشتر
در سیستم قفس سرمایه اولیه لازم برای شروع پرورش مرغ تخمگذار خیلی بیشتر است . اما با توجه به مزایای قفس می توان گفت که در سال های اول پرورش این هزینه جبران خواهد شد .
حمایت از حیوانات
در سیستم قفس مرغ ها آزاد نیستند و از راحتی کمتری برخوردار هستند . انجمن حمایت از حیوانات چندیست که مخالفت خود را بابت پرورش مرغ ها در قفس هشدارها و اعتراضات خود را اعلام کرده است